В настоящей работе выполнен сравнительный анализ различных источников, моделей и организационных схем финансирования инновационной деятельности в Европе и России. Ориентация на европейский опыт объясняется неразвитостью российского фондового рынка и тяготением к банковской модели финансирования. Показано, что для создания инновационно-ориентированной экономики в условиях серьезного технологического отставания России необходима консолидация финансовых ресурсов на проведении научных исследований по приоритетным направлениям, выполняемых лучшими исследовательскими коллективами с наибольшим синергетическим взаимодействием. Консолидация финансовых ресурсов при этом может быть достигнута с использованием механизма проектного финансирования, а консолидация исследовательских ресурсов и обеспечение конкурентоспособности научных разработок – посредством формирования и развития научно-инновационных сетей.